“蛋白质组发现：无标记定量”是当前蛋白质组学研究中常用且高效的定量分析策略之一。该方法指的是在不引入稳定同位素或化学标签的前提下，直接通过质谱仪检测不同样本中蛋白质或肽段的信号强度来实现相对定量。作为一种基于质谱信号强度比较的策略，“蛋白质组发现：无标记定量”以其简便的实验设计、较低的成本和较高的通量被广泛应用于生物标志物筛选、疾病机制研究、药物作用分析等多个方向。在探索未知蛋白质表达差异或动态变化的研究中，“蛋白质组发现：无标记定量”能够在保证数据精度的前提下提供高覆盖度的蛋白质信息，这有助于科学家快速锁定潜在的功能蛋白及其调控路径。“蛋白质组发现：无标记定量”的实验流程相对清晰高效，通常包括样本蛋白提取、酶解、液相色谱分离与质谱检测，再结合计算分析进行蛋白质鉴定与定量。样本不需额外处理，避免了标记效率不均、反应副产物等问题，保留了蛋白质在生理条件下的自然状态。这种方法依赖于质谱仪对肽段离子的峰面积或峰强度进行提取，常见的分析策略包括基于MS1信号强度的峰面积比较以及基于谱图计数的相对丰度估计。“蛋白质组发现：无标记定量”可以覆盖上千种蛋白，尤其适用于复杂生物样本，如组织、体液或细胞系等。

在数据分析方面，“蛋白质组发现：无标记定量”高度依赖于计算方法的支持。首先需要使用搜索引擎（如MaxQuant、Proteome Discoverer等）对质谱数据进行蛋白质鉴定；随后利用峰强度提取、数据归一化和统计模型分析差异表达蛋白。这一过程中，信号提取精度、对齐算法的鲁棒性以及缺失值处理策略直接影响最终结果的可信度。高水平的计算分析不仅可提高蛋白质定量的一致性，也能有效减少假阳性率。值得强调的是，在整个数据处理流程中，保持技术重复性和严格的质控标准是确保“蛋白质组发现：无标记定量”结果可靠性的关键。

“蛋白质组发现：无标记定量”的核心优势在于无需复杂的标记试剂，实验流程更加灵活，样本类型的适应性强，特别适合开展大规模、多条件比较的蛋白质筛选研究。同时，该方法对样本的初始蛋白量要求相对较低，具备较高的分析通量和动态范围，能够捕捉从高丰度到中低丰度蛋白的表达变化。相较于标记定量方法，无标记策略避免了不同批次标记效率差异的问题，更适合长期项目或跨批次数据整合。

“蛋白质组发现：无标记定量”也存在一定局限，其定量精度较依赖质谱仪器性能和样本处理的一致性，跨批次分析时信号漂移可能引入系统误差。此外，低丰度蛋白在无标记策略中易受背景干扰影响，导致识别效率下降。为提高数据质量，通常需要结合严格的样本随机化策略和质控流程，同时在分析阶段采用归一化与多重假设检验等统计方法，确保定量结果的统计显著性。

百泰派克生物科技拥有丰富的项目经验和专业的数据分析能力，我们提供高质量的蛋白质组分析服务，涵盖从实验设计、数据采集到生物信息解读的全流程支持，助力客户高效获取可信赖的研究成果。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

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