蛋白质翻译后修饰（PTMs）是调控细胞功能的核心机制之一，而乙酰化（acetylation）作为最常见的PTM之一，在基因表达调控、染色质重构、代谢调节等多个生物过程中发挥作用。随着蛋白质组学研究的深入，科研人员愈发关注如何系统性地识别和定量乙酰化修饰，以揭示其在疾病发生、细胞应激和药物响应中的作用机制。质谱（Mass Spectrometry, MS）作为高灵敏度、高通量的核心技术平台，已成为乙酰化蛋白质组学研究的工具。从乙酰化肽段的选择性富集到高分辨率的质谱识别，再到TMT或无标记策略下的精准定量，质谱贯穿了整个乙酰化研究流程，显著提升了修饰蛋白的识别深度与定量准确性。

一、蛋白质乙酰化：关键的翻译后修饰机制

1、乙酰化的分类与功能

蛋白质乙酰化主要包括N-末端乙酰化（N-terminal acetylation）和赖氨酸残基乙酰化（lysine acetylation），其中后者更为常见，广泛参与调控蛋白稳定性、酶活性、蛋白互作和亚细胞定位等功能。

2、乙酰化的可逆调控机制

乙酰化修饰由乙酰转移酶（KATs）和去乙酰化酶（HDACs）动态调控，形成一套类似磷酸化系统的可逆调控网络。异常的乙酰化水平常与肿瘤、代谢紊乱、神经退行性疾病等病理状态密切相关。

二、乙酰化蛋白质组学研究的挑战

1、修饰丰度低、检出难度大

（1）乙酰化修饰在细胞内通常属于低丰度事件，难以在传统蛋白质组方法中被检出。

（2）大量背景蛋白信号可能掩盖乙酰化肽段，需高特异性富集策略辅助检测。

2、位点复杂性高，需精准定位

（1）同一蛋白可能存在多个赖氨酸乙酰化位点，具有高度结构异质性。

（2）部分位点与其他修饰（如甲基化、泛素化）存在竞争关系，增加解析难度。

3、样本处理流程影响数据质量

消化方案、抗体富集效率、肽段纯化方法均对检测灵敏度与重复性有显著影响。

三、乙酰化蛋白质组学的核心技术平台：质谱

1、富集策略：精准锁定乙酰化肽段

（1）免疫富集是目前主流方法，利用高亲和力抗乙酰化赖氨酸抗体提纯修饰肽段。

（2）配合多维分级策略，如高pH反相分离（HpH-RP），可有效提升检测通量和覆盖度。

2、高分辨率质谱仪助力高质量检测

（1）如Orbitrap Fusion Lumos、Q-Exactive HF-X等平台，具备亚ppm级质量精度与高速扫描能力。

（2）HCD（Higher-energy C-trap Dissociation）碎裂方式在保留乙酰化修饰的同时生成高质量的MS/MS图谱，便于修饰位点的准确定位。

3、定量策略：精确描绘乙酰化动态变化

（1）TMT/iTRAQ标记定量

• 适用于多组学并行比较，能够评估不同处理条件下乙酰化水平的微小差异。
• 在药物筛选、时间梯度实验中广泛应用。

（2）Label-Free无标记定量

• 基于肽段强度进行统计分析，操作流程简便、成本低。
• 更适合高样本量的疾病队列研究。

四、生物信息分析：从质谱数据到机制洞察

1、修饰位点注释与功能富集分析

（1）借助数据库（如PhosphoSitePlus、Uniprot）进行位点识别与功能注释。

（2）结合GO、KEGG通路富集，挖掘关键生物过程与信号通路。

2、蛋白互作网络构建（PPI）

（1）通过STRING等数据库构建乙酰化蛋白之间的互作网络。

（2）识别潜在调控中心节点与协同调控模块。

3、定量动态变化分析

（1）统计乙酰化水平在不同处理组的变化趋势。

（2）结合组学或表型数据挖掘潜在机制。

五、应用场景：乙酰化修饰的研究前沿

1、肿瘤学：乙酰化修饰可调节癌基因和抑癌基因表达，在肿瘤分型与靶点发现中具有重要价值。

2、神经科学：研究乙酰化对突触蛋白、转录因子的调控，有助于揭示阿尔茨海默症等疾病机制。

3、表观遗传学：乙酰化是组蛋白修饰的重要形式，影响染色质构象和转录活性，成为研究转录调控的切入点。

4、药物作用机制：评估小分子对KATs/HDACs活性的干预效应，是表观药物开发的重要方向。

乙酰化蛋白质组学正成为解析生物调控网络的工具，而质谱则为这一研究方向提供了坚实的技术支撑。从肽段富集、高分辨检测到定量分析与生信解析，每一步都依赖高水平的质谱平台与专业的技术团队。百泰派克生物科技专注于高通量蛋白质组学服务，依托先进的Orbitrap系统与优化的富集方案，已协助多家高校与企业完成乙酰化修饰相关项目，成果覆盖肿瘤、神经、代谢、免疫等多个方向。欢迎联系我们，共同推动乙酰化蛋白质组学研究迈向更深层次。

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

>>点击了解更多优质服务项目